Yazar "Khan, Kamran" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 3 / 3
  • Küçük Resim
    Öğe
    Characterization of somatic metaphase chromosomes in bottle gourd (lagenaria siceraria)
    (Niğde Ömer Halisdemir Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü, 2020) Khan, Kamran; Tek, Ahmet Latif
    On the basis of chromosome structure, cytogenetic studies provide an important understanding of the genomic and genetic features of the species and play a critical role in the recognition of species and breeding programs. To detect the AT-rich and GC-rich regions as well as nucleolar organizer regions (NORs) on the different mitotic stages CMA3/DAPI and silver nitrate staining (banding methods) were used. For the chromosome study, ribosomal genes (rDNAs) are important cytogenetic markers. The main aim of this research was to find numbers and locations of ribosomal genes (rDNAs) 45S and 5S on metaphase chromosomes of bottle gourd by using FISH. The results showed that there were 4 numbers of signals of 45S were present in interphase, 4 numbers of signals of 45S in prophase, 4 numbers of signals of 45S on metaphase chromosomes at the subtelomeric or terminal region and 2 signals of 5S were present at the sub-telomeric or a terminal region of metaphase chromosomes. These results will provide important knowledge about chromosome structure, genome structure and phylogenetic relationships in Cucurbitaceae species. Keywords: cytogenetic markers, rDNA, FISH, sub-telomeric, genome structure
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Characterization of somatic metaphase chromosomes in bottle gourd (lagenaria siceraria).
    (Niğde Ömer Halisdemir Üniversitesi, 2020) Khan, Kamran; Tek, Ahmet Latif
    Kromozom yapısı temelinde, sitogenetik çalışmalar türlerin genomik ve genetik özellikleri hakkında önemli bir anlayış sağlar ve türlerin ve yetiştirme programlarının tanınmasında kritik bir rol oynamaktadır. Bu çalışmada, AT açısından zengin ve GC açısından zengin bölgeleri ve farklı mitotik aşamalarda nükleolar düzenleyici bölgeleri (NOR) tespit etmek için CMA3/DAPI ve gümüş nitrat boyaması (bantlama yöntemleri) kullanılmıştır. Kromozom çalışması için ribozomal genler (rDNA'lar) önemli sitogenetik belirteçlerdir. Bu araştırmanın temel amacı, su kabağının metafaz kromozomları üzerinde ribozomal genlerin (rDNA'lar) 45S ve 5S sayılarını ve yerlerini FISH kullanarak bulmak olmuştur. Sonuçlar, interfazda 45S sinyalinin, profazda, subtelomerik fazda veya terminal bölgedeki metafaz kromozomlarında sırasıyla 4, 4 ve 2 adet , sinyalin bulunduğunu göstermektedir. Metafaz kromozomlarının sub-telomerik veya terminal bölgesinde 5S'in varlığı kayıd edilmiştir. Bu sonuçlar, cucurbitaceae türleri arasındaki kromozom yapısı, genom yapısı ve filogenetik ilişkiler hakkında önemli bilgiler sağlamaktadır. Anahtar Sözcükler: sitogenetik markerler, rDNA, FISH, sub-telomerik, genom yapısı
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Chromomycin A3 banding and chromosomal mapping of 45S and 5S ribosomal RNA genes in bottle gourd
    (Firenze Univ Press, 2021) Tek, Ahmet L.; Yildiz, Humeyra; Khan, Kamran; Yildirim, Bilge S.
    Ribosomal DNAs and various banding patterns are landmarks in molecular cytogenetics providing useful information for karyotyping and addressing individual chromosomes. Bottle gourd is the only cultivated species of the Lagenaria genus with high genetic diversity. After CMA(3)/DAPI fluorochrome banding we investigated the GC- and AT-rich regions in interphase nuclei of five different local accessions. Fluorescence in situ hybridization (FISH) was conducted to determine the number and location of 45S and 5S rDNAs in bottle gourd. Our results showed four strong CMA(3) regions in interphase and on mitotic metaphase chromosomes. FISH revealed four strong signals of 45S rDNA at the termini of two metaphase chromosome pairs and terminal 5S rDNA signals at another pair of chromosomes. The presence of four positive CMA(3) bands colocalizes with four 45S rDNA signals in all bottle gourd accessions. Our results allow distinguishing two out of eleven chromosome pairs of bottle gourd.