Yazar "Abudureyimu, Buasimuhan" seçeneğine göre listele
Listeleniyor 1 - 4 / 4
Sayfa Başına Sonuç
Sıralama seçenekleri
Öğe Arpa Nikotinamin Sentaz1 (HvNAS1) Genini Yüksek Seviyede İfade Eden Arabidopsis thaliana Bitkileri Demir Eksikliğine Dayanıklılık Gösterir(2020) Aksoy, Emre; Maqbool, Amir; Abudureyimu, BuasimuhanDemir (Fe) bitki gelişimi için önemli bir eser element olup, Fe eksikliğinde yetişen bitkilerde gelişen kloroza bağlı olarak verim kayıpları yaşanır. Bu kayıpların en aza indirilebilmesi için alınabilecek agronomik önlemlere ilaveten genetik mühendisliği aracılığıyla bitkilerin özellikleri etkin bir şekilde geliştirilebilir. Rizosferde yüksek miktarda bulunan demiri köklerine alabilmek için Arabidopsis thalianagibi dikotlar indirgenme temelli bir stratejiyi kullanırlarken, arpanın (Hordeum vulgare) da yer aldığı graminelerde şelasyon stratejisi evrimleşmiştir. Bu çalışmada, arpada bulunan ve demir ile kompleks oluşturabildiği bilinen nikotinaminin üretiminden sorumlu NİKOTİNAMİN SENTAZ1(HvNAS1) geni klonlanarak, Arabidopsis bitkilerinde konstitütif olarak yüksek seviyede ifade edilmiştir. Elde edilen T3Arabidopsis bitkilerinde HvNAS1ile birlikte demir alımından sorumlu yolakta yer alan Arabidopsis genlerinin de ifade seviyelerinin arttığı belirlenmiştir. Buna bağlı olarak, bitkilerin kök uzunluklarının, kök ve gövde yaş ağırlıklarının, ferrik şelat redüktaz enzim aktivitelerinin de arttığı belirlenmiştir.Ayrıca, transgenik Arabidopsis bitkilerinin kök ve gövdelerinde biriken demir ve çinko seviyelerinde önemli artışlar belirlenmiştir. Sonuç olarak, arpa HvNAS1genini yüksek seviyede ifade eden trangenik Arabidopsis bitkilerinin rizosferden daha fazla demir alabildiği ve bu demiri daha fazla gövdeye taşıyabildiği gösterilmiştir. Bu sayede genetik mühendisliği kullanılarak HvNAS1genini yüksek seviyede ifadeeden ve demir eksikliğine dayanıklı Arabidopsis bitkileri geliştirilmiştir.Öğe Bitkilerde Rizosferden Demir Alım Mekanizmaları(2018) Aksoy, Emre; Yerlikaya, Bayram Ali; Ayten, Sefa; Abudureyimu, BuasimuhanDemir, toprakta en çok bulunan elementlerden bir tanesi olmasına karşın çözünürlüğüalkali topraklarda düşüktür. Dolayısıyla bu tür topraklarda yetişen bitkiler sürekli demireksikliği stresine maruz kalırlar. Dünyadaki tarım arazilerin üçte biri bu tür topraklardanoluştuğundan dolayı tedavi edilemeyen demir eksikliği tarımsal üretimi kısıtlar.Bitkilerde gözlenen demir eksikliğinin tedavisinde farklı demir gübrelerikullanılmaktadır. Ancak, bu gübrelerin kullanımı üretim maliyetlerini artırmaktadır.Maliyetlerin azaltılabilmesi için bitkilerin toprakta bulunan demiri en etkin biçimdekullanabilmeleri gerekir. Bunun için de ilk olarak bitkilerin topraktaki demiri nasıl kökiçerisine aldıklarının incelenmesi gerekmektedir. Son otuz yılda yapılan çalışmalardafarklı bitki gruplarının 3 farklı demir alım mekanizması kullandıkları keşfedilmiştir. Buderlemenin amacı, demirin kök içerisine alımından sorumlu taşıyıcılar ile bu taşıyıcılarhakkındaki güncel gelişmelerden bahsetmektir.Öğe Effect of climate change on abiotic stress response gene networks in Arabidopsis thaliana(Springer International Publishing, 2022) Yerlikaya, Bayram Ali; Ates, Dilan; Abudureyimu, Buasimuhan; Aksoy, EmreClimate change leads to various abiotic stresses that the plants face within their life cycles. This leads to extensive biochemical, physiological, and morphological changes in plants. Plants have evolved several defense mechanisms to survive in abiotic stress conditions, and all of these mechanisms include the differential expression of hundreds of genes involved in tens of different biological pathways. Recent systems biology approaches have identified a core gene network that is essential in abiotic stress tolerance in plants. However, a more detailed analysis is required to understand the core transcriptional regulatory network of stress-responsive genes in the model plant Arabidopsis thaliana. Here we explain the identification of a core transcriptional regulatory network of stress-responsive genes in Arabidopsis by bioinformatic analyses under several abiotic stress conditions. Then, known functions of identified transcription factor families are discussed in detail. © The Author(s), under exclusive license to Springer Nature Switzerland AG 2022. All rights reseverd.Öğe SOS Yolağından Sorumlu Arabidopsis Mutantlarının Tuz Stresi Altındaki Hassasiyetlerinin Karşılaştırılması(2019) Abudureyimu, Buasimuhan; Aksoy, EmreTuz stresi bitkilerde önemli fizyolojik ve metabolik değişimlere yol açarak bitki büyüme vegelişimini olumsuz şekilde etkileyen, ürün kalitesinin ve miktarının azalmasına neden olan en önemlive yaygın abiyotik stres faktörlerinden birisidir. Tuz stres toleransı ile ilgili moleküler kontrolmekanizmalarının aydınlatılması stres ile ilişkili çeşitli genlerin aktivasyonu ve/veyainaktivasyonuna dayanmaktadır. Tuz stresi altında Salt Overly Sensitive (SOS) mekanizmasıbitkinin tuza toleransı açısından büyük önem taşımaktadır. Her ne kadar bu mekanizma uzunyılalrdır çalışılmış olsa da, yolakta yer alan genlerin mutasyonu sonucunda elde edilen bitkilerinfarklı sodyum klorür (NaCl) seviyelerine karşı gelişim süresince vermiş oldukları fizyolojikdeğişiklikler karşılaştırmalı olarak incelenmemiştir. Arabidopsis thaliana’da yaptığımız buçalışmada, sos1-1 mutant bitkisinin 10 mM NaCl uygulamasına hassasiyet gösterirken sos3-1 vehkt1-1 mutant bitkilerinin ise dayanıklılık gösterdiği; 50 mM NaCl ve üstü konsantrasyonlarda isesos1-1, sos3-1 ve hkt1-1 mutant bitkilerinin hassas olduğu belirlenmiştir. Ayrıca 1 gün stresuygulanan bitkiler çok hassas değilken, stresin 3 veya 4 gün devam etmesi sonucunda bitkilerin kökuzunluğunda belirgin etkilenme gözlemlenmiştir. Kısa süreli ve düşük seviyede NaCl uygulananCol-0, hkt1-1 ve sos3-1 köklerinin gelişiminin pozitif yönde etkilendiği bulunmuştur. Bu sonuçlarışığında Arabidopsis thaliana’nın tuz stresine karşı göstermiş olduğu tepkilerin detaylı incelenmesive moleküler tolerans yolaklarının belirlenmesinde tuz stres miktarı ve süresinin ne kadar önemliolduğu belirlenmiştir.