Yazar "Dangol, Sarbesh Das" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 4 / 4
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Genome editing for nutrient use efficiency in crops
    (Springer International Publishing, 2022) Yağiz, Ayten Kübra; Yavuz, Caner; Naeem, Muhammad; Dangol, Sarbesh Das; Aksoy, Emre
    Plant breeders have concentrated on increasing the yields, and in turn, the production in the last century to meet the increasing food demand, while ignoring the nutrition values of staple food crops. However, the malnutrition pandemic showed us that plant breeding should also focus on enhancing the nutritional quality of staple foods. Therefore, crop biofortification is one of the major goals of today's agriculture to eliminate malnutrition in the world. There are different strategies of crop biofortification, ranging from conventional to molecular breeding to transgenics. On the one hand, crop breeding seems to be a logical strategy to develop new nutritious varieties, but it takes much longer and requires manpower. On the other hand, transgenic technologies can shorten the time to develop new varieties and require less effort. Even though the obvious advantages of the transgenic technologies, transgenic crop varieties cannot be taken to the market because of strong public opposition. For this very reason, genome editing can facilitate transgene-free variety production. CRISPR/Cas-based genome editing has been used in many aspects of plant science to understand the function of the gene(s), to develop stress-tolerant varieties, and of course to develop biofortified crops. This chapter describes crop biofortification studies using conventional transgenic and genome editing technologies. © The Author(s), under exclusive license to Springer Nature Switzerland AG 2022. All rights reseverd.
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Knockout of invertase inhibitor gene by CRISPR/CAS9 method in potato
    (Niğde Ömer Halisdemir Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü, 2021) Dangol, Sarbesh Das; Çalışkan, Mehmet Emin; Bakhsh, Allah
    Patateste zarar yapan ve verimi düşüren çeşitli hastalık etmenleri her yıl büyük ölçüde ekonomik kayıplara neden olmaktadır. Apoplastik (hücre duvarı) invertaz enzimi, patojen enfeksiyonu durumunda apoplastik invertaz inhibitörü tarafından post-translasyonel olarak düzenlenen bitki savunma mekanizmasında potansiyel bir rol oynayabilir. Bu çalışmada, patateste apoplastik invertaz inhibitör genini hedeflemek için CRISPR/Cas9 teknolojisi kullanılmıştır. Diploid Solanum chacoense türüne ait M6 genotipi ve tetraploid Solanum tuberosum türüne ait Desiree çeşidinin halihazırda mevcut DNA dizi bilgileri kullanılarak bu geni hedefleyen iki tek kılavuzlu RNA (sgRNA) tasarlanmıştır. Eşzamanlı olarak, bir intron dizisi ile kesilen gusA geni içeren pBIN19 ekspresyon vektörünü barındıran GV2260 suşu kullanılarak, dönüşüme dirençli S. chacoense M6 genotipi için Agrobacterium aracılı bir dönüştürme protokolü geliştirilmiştir. Bu protokol kullanılarak hem transkript hem de protein seviyelerinde gusA genini ifade eden transgenik S. chacoense M6 bitkilerinin rejenerasyonu sağlanmıştır. Etkisileştirme denemelerinde, kallus için Sanger dizi bilgisi kullanılarak indeller gözlenmiş ve rejenere olan aday bitkilerin azaltılmış gen ekspresyon seviyesi sergilediği RT-qPCR ile gösterilmiştir. Apoplastik invertaz inhibitör geninin patateste stres tepkisi ve savunma mekanizmalarındaki rolünü anlamak için yeni çalışmalara ihtiyaç vardır.Patateste zarar yapan ve verimi düşüren çeşitli hastalık etmenleri her yıl büyük ölçüde ekonomik kayıplara neden olmaktadır. Apoplastik (hücre duvarı) invertaz enzimi, patojen enfeksiyonu durumunda apoplastik invertaz inhibitörü tarafından post-translasyonel olarak düzenlenen bitki savunma mekanizmasında potansiyel bir rol oynayabilir. Bu çalışmada, patateste apoplastik invertaz inhibitör genini hedeflemek için CRISPR/Cas9 teknolojisi kullanılmıştır. Diploid Solanum chacoense türüne ait M6 genotipi ve tetraploid Solanum tuberosum türüne ait Desiree çeşidinin halihazırda mevcut DNA dizi bilgileri kullanılarak bu geni hedefleyen iki tek kılavuzlu RNA (sgRNA) tasarlanmıştır. Eşzamanlı olarak, bir intron dizisi ile kesilen gusA geni içeren pBIN19 ekspresyon vektörünü barındıran GV2260 suşu kullanılarak, dönüşüme dirençli S. chacoense M6 genotipi için Agrobacterium aracılı bir dönüştürme protokolü geliştirilmiştir. Bu protokol kullanılarak hem transkript hem de protein seviyelerinde gusA genini ifade eden transgenik S. chacoense M6 bitkilerinin rejenerasyonu sağlanmıştır. Etkisileştirme denemelerinde, kallus için Sanger dizi bilgisi kullanılarak indeller gözlenmiş ve rejenere olan aday bitkilerin azaltılmış gen ekspresyon seviyesi sergilediği RT-qPCR ile gösterilmiştir. Apoplastik invertaz inhibitör geninin patateste stres tepkisi ve savunma mekanizmalarındaki rolünü anlamak için yeni çalışmalara ihtiyaç vardır.
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Role of genetic engineering in improving potato production
    (Elsevier, 2022) Saeed, Faisal; Dangol, Sarbesh Das; Hashmi, Muneeb Hassan; Hossain, Md Jakir; Bakhsh, Allah
    Potato is believed to be one of the most significant noncereal food crops to address the food security concerns in future for the increasing population worldwide. Potatoes are rich in vitamins, minerals, and antioxidants that make them of paramount significance for impressive health benefits besides. Numerous improvements have been introduced in potatoes for yield and yield contributing traits; however, limitation still exist especially when it comes to abiotic and biotic stresses. Recently, developments in genetic engineering have revolutionized potato breeding remarkably by addressing bottlenecks encountered in conventional potato breeding successfully. The new breeding techniques have allowed the researchers to add, remove, alter, and manipulate gene(s) to encode tolerance/resistance against abiotic and biotic stresses. The improvements in cell biology to regenerate plants from single cells or organized tissues provide a prerequisite for the practical use of genetic engineering in crop improvement. In addition to that, the quality of the potato has also been improved significantly for industrial purposes. This chapter provides a comprehensive understanding of how genetic engineering has contributed to potato improvement in terms of quality, insect pests, and diseases. It also discusses how these modern techniques can shape potato breeding programs for the development of climate-resilient cultivars in future. © 2023 Elsevier Inc. All rights reserved.
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Transformation efficiency of five agrobacterium strains in diploid and tetraploid potatoes
    (ResearchersLinks Ltd, 2019) Dönmez, Betül Ayça; Dangol, Sarbesh Das; Bakhsh, Allah
    Development of transgenic potatoes is imperative to investigate various gene functions as well as to develop robust potato varieties resistant to different biotic and abiotic stresses, specially in diploid potato and to redirect the breeding program away from tetraploids to the diploids. We aimed to develop the protocol for transformation of Solanum chacoense diploid M6 potato using tetraploid S. tuberorsum cv. Desiree as a control using five different Agrobacterium strains harboring pBIN19 binary vector that further contains gusA gene, interrupted by an intronic sequence, under the control of 35S CaMV promoter. After transformation, we analyzed the transformation efficiencies of each of the Agrobacterium strains using the histochemical GUS analysis. The highest gusA gene transfer efficiency rate both for leaf (60%) and internode (100%) explants was observed in cv. Desiree using Agrobacterium strain GV2260, while the highest gene transfer efficiency rate for leaf and internode explants in S. chacoense M6 were obtained with AGL1. The highest callus formation for both cv. Desiree and S. chacoense M6 was obtained on cv. Desiree leaf explants, transformed via the Agrobacterium strain GV2260. The lowest callus formation, for both S. chacoense M6 and cv. Desiree, were obtained from internode explants. About 33% calli induction was achieved from transformation mediated by AGL1 strain in cv. Desiree, and about 23 % from LBA4404 strain in S. chacoense M6. This study will further aid in the development of stable transgenic potatoes, especially in diploid cultivars. © 2020.