Pelemir ( Cephalaria syriaca ) genomunda yer alan tekrarlayan DNA dizilerinin moleküler klonlanması

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.advisorTek, Ahmet Latif
dc.contributor.authorKara, Sevim Döndü
dc.date.accessioned2019-11-04T12:56:16Z
dc.date.available2019-11-04T12:56:16Z
dc.date.issued2018
dc.date.submitted2018-06
dc.departmentNiğde ÖHÜ, Fen Bilimleri Enstitüsü, Tarımsal Genetik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
dc.description.abstractYeryüzündeki yaşamın sürekliliği için bitkiler mutlak gereklidir. Bir bitkinin hücre çekirdeğindeki haploid kromozom setini oluşturan DNA miktarının tamamı, o bitkinin genomunu oluşturur. Genellikle bitki genom büyüklüğü, genom yapısı ve bu yapının özellikleri türe özgüdür. Genom büyüklüğündeki değişkenliklerin temelini genomda farklı yaygınlıkta ve farklı özellikleriyle yer alan tekrarlayan DNA dizileri oluşturmaktadır. Bu çalışmada yeni kültüre alınıp çeşit tescili yapılan pelemir (Cephalaria syriaca L.) bitkisinin genomunu oluşturan ve genom içinde yaygın olarak bulunan tekrarlayan DNA elementlerinin tanımlanması hedeflenmiştir. Bu amaca sistematik olarak ulaşmak için pelemir bitkisinin genom ve kromozom özelliklerinin analizine yönelik ribozomal DNA’ların kromozom üzerindeki yerlerinin tespit edilmesi, rekombinant klon temelli tekrar dizilerinin izolasyonu, yeni nesil dizileme verilerinin biyoinformatik analizi ve elde edilen satelit tekrarların FISH yöntemiyle haritalanması gerçekleştirilmiştir. Bu tanımlamalar, pelemir genom yapısını oluşturan DNA elementlerinin içeriğine ve dinamiklerine ışık tutan ilk kapsamlı çalışmayı oluşturmaktadır.
dc.description.abstractPlants are necessary for the continuity of life on Earth. The amount of DNA that makes up the haploid chromosome set in the cell nucleus of a plant is called the genome. Generally, plant genome size, genome structure, and features of this structure are species specific. The basis of variability in genome size is the repetitive DNA sequences present in the genome with different abundance and different characteristics. In this study, we aimed to identify the repetitive DNA elements, which are common in the genome of Cephalaria syriaca L.. In order to systematically achieve this goal, mapping of ribosomal DNA sites on chromosomes, isolation of recombinant clone-based repeat sequences, and bioinformatics analysis of next generation sequencing data were performed for analysis of genomic and chromosomal characteristics of Cephalaria syriaca L.. Our results constitute the first comprehensive study that sheds light on the content and dynamics of the DNA elements forming the Cephalaria genome structure.
dc.identifier.citationKara, S. D. (2018). Pelemir ( Cephalaria syriaca ) genomunda yer alan tekrarlayan DNA dizilerinin moleküler klonlanması. (Yüksek Lisans Tezi) Niğde Ömer Halisdemir Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Niğde
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11480/7009
dc.identifier.yoktezid514571
dc.institutionauthorKara, Sevim Döndü
dc.language.isotr
dc.publisherNiğde Ömer Halisdemir Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü
dc.relation.publicationcategoryTez
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.subjectCephalaria Syriaca
dc.subjectTekrarlayan DNA
dc.subjectSatelit DNA
dc.subjectrDNA
dc.subjectFISH
dc.subjectDot Blot
dc.subjectGenom
dc.subjectYND
dc.subjectCephalaria Syriaca
dc.subjectRepetitive DNA
dc.subjectSatellite Repeats
dc.subjectrDNA
dc.subjectFISH
dc.subjectDot Blot
dc.subjectGenome
dc.subjectNGS
dc.titlePelemir ( Cephalaria syriaca ) genomunda yer alan tekrarlayan DNA dizilerinin moleküler klonlanması
dc.title.alternativeMolecular cloning of repetitive DNA sequences in the genome of cephalaria ( Cephalaria syriaca )
dc.typeMaster Thesis

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
Pelemir ( Cephalaria syriaca ) genomunda yer alan tekrarlayan DNA dizilerinin moleküler klonlanması.pdf
Boyut:
3.97 MB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin / Full Text
İndir
Lisans paketi
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim Yok
İsim:
license.txt
Boyut:
1.44 KB
Biçim:
Item-specific license agreed upon to submission
Açıklama:
İndir

Koleksiyon

Fen Bilimleri Enstitüsü Tez Koleksiyonu