Evaluation of antibiotic susceptibilities of enterococcus strains isolated from clinical samples of hospitalized patients

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.authorÖdemiş, Ilker
dc.contributor.authorKöse, Şükran
dc.contributor.authorErsan, Gürsel
dc.contributor.authorçelik, Didem
dc.contributor.authorAkbulut, Ilkay
dc.date.accessioned2024-11-07T10:39:39Z
dc.date.available2024-11-07T10:39:39Z
dc.date.issued2018
dc.departmentNiğde Ömer Halisdemir Üniversitesi
dc.description.abstractObjective: Enterococci can cause urinary tract infection, wound infection and bacteremia. It is one of the most commonly detected agents in hospitalacquired infections. Increasing resistance to antibiotics has been observed in enterococci in recent years. The distribution of enterococci isolated from cultures and antibiotic resistance may vary between health care centers, so it would be beneficial for each center to evaluate its own results at certain intervals. The aim of this study is to determine the antibiotic resistance rates of Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium strains isolated from urine, blood, wound, sputum and cerebrospinal fluid (CSF) specimens of patients hospitalized in our hospital, such as ampicillin, gentamicin, streptomycin, ciprofloxacin, vancomycin, teicoplanin and linezolid. Methods: Between January 2010 and January 2015, 390 Enterococcus strains isolated from various clinical specimens of patients in Izmir Tepecik Training and Research Hospital were evaluated retrospectively. Identification and antibiotic susceptibility testing of the enterococci strains were performed by fully automated bacterial identification system VITEK-2 (bioMerieux, France). Vancomycin, teicoplanin and linezolid resistance was also tested by the E-test method (bioMerieux, Fransa). Susceptibility results were evaluated according to the guidelines of Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Results: A total of 390 strains were identified as follows; 154 (%40) were E. faecalis, 236 (%60) were E. faecium. Clinical specimens from which E. faecium strains were isolated were; 126 (53%) urine, 65 (27%) blood, 39 (17%) wound, 4 (2%) sputum and 2 (1%) CSF. Clinical specimens from which E. faecalis strains were isolated were; 77 (50%) urine, 50 (33%) blood, 22 (14%) wound, 3 (2%) sputum and 2 (1%) CSF. Linezolid was the most sensitive antibiotic against both E. faecalis and E. faecium strains, Ampicillin was the most resistant antibiotic for both E. faecalis and E. faecium strains. Conclusion: In our study; the detection of high ampicillin, vancomycin and teicoplanin resistance in both E. faecalis and E. faecium strains is considered to be a data that should be taken into consideration in the selection of empirical antibiotics for these strains. © 2018 Refik Saydam National Public Health Agency (RSNPHA).; Amaç: Enterokoklar idrar yolu yara yeri enfeksiyonlari ile bakteriyemiye neden olabilmektedir. Hastane kökenli enfeksiyonlarda en sik saptanan etkenlerden birisidir. Enterokoklarda son yillarda antibiyotiklere karşi artan oranda direnç gözlenmektedir. Kültürlerden izole edilen enterokoklarin dağilimi ve antibiyotik direncinin sağlik bakim merkezleri arasinda değişebildiği, bu nedenle de merkezin kendi sonuçlarini belli araliklarla değerlendirmesinin faydali olacaği düşünülmüştür. Bu çalişmanin amaci hastanemizde yatan hastalarin idrar, kan, yara, balgam ve beyin omurilik sivisi (BOS) örneklerinden izole edilen Enterococcus faecalis ve Enterococcus faecium suşlarinin ampisilin, gentamisin, streptomisin, siprofloksasin, vankomisin, teikoplanin ve linezolid gibi antibiyotiklere direnç oranlarini belirlemektir. Yöntem: Ocak 2010 - Ocak 2015 arasinda Izmir Tepecik Eğitim ve Araştirma Hastanesinde yatan hastalarin çeşitli klinik örneklerinden izole edilen 390 enterokok suşu retrospektif olarak değerlendirilmiştir. Suşlarin identifikasyonu ve antibiyotik duyarliliklari; tam otomatize bakteri tanimlama sistemi VITEK-2 (bioMerieux, Fransa) ile çalişilmistir. Vankomisin, teikoplanin ve linezolid duyarliliklari E-test (bioMerieux, Fransa) ile de test edilmiştir. Duyarlilik sonuçlari ise Clinical and Laboratory Standarts Institute (CLSI) kriterleri esas alinarak belirlenmiştir. Bulgular: Identifiye edilen toplam 390 susun 154 (%40)'ü E. faecalis, 236 (%60)'si E. faecium olarak tanimlandi. E. faecium suşlarinin izole edildikleri klinik örnekler sirasiyla; 126 (%53)'si idrar, 65 (%27)'i kan, 39 (%17)'u yara yeri, 4 (%2)'ü balgam ve 2 (%1)'si BOS'dur. E. faecalis suşlarinin izole edildikleri klinik örnekler ise 77 (%50)'si idrar, 50 (%33)'si kan, 22 (%14)'si yara yeri, 3 (%2)'ü balgam ve 2 (%1)'si ise BOS'dur. E. faecalis ve E. faecium suşlarinin her ikisi için en duyarli bulunan antibiyotik linezolid'dir. Hem E. faecalis hem de E. faecium için en dirençli antibiyotiğin ampisilin olduğu saptandi. Sonuç: çalişmamizda hem E. faecalis hem de E. faecium suşlarinda ampisilin, vankomisin ve teikoplanin direncinin yüksek saptanmasi, bu suşlara yönelik ampirik antibiyotik seçiminde dikkate alinmasi gereken bir veri olduğu düşünülmektedir. © 2018 Refik Saydam National Public Health Agency (RSNPHA).
dc.identifier.doi10.5505/TurkHijyen.2018.70456
dc.identifier.endpage352
dc.identifier.issn0377-9777
dc.identifier.issue4
dc.identifier.scopus2-s2.0-85059468126
dc.identifier.scopusqualityQ4
dc.identifier.startpage345
dc.identifier.trdizinid351357
dc.identifier.urihttps://doi.org/10.5505/TurkHijyen.2018.70456
dc.identifier.urihttps://search.trdizin.gov.tr/tr/yayin/detay/351357
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11480/11113
dc.identifier.volume75
dc.indekslendigikaynakScopus
dc.indekslendigikaynakTR-Dizin
dc.language.isotr
dc.publisherRefik Saydam National Public Health Agency (RSNPHA)
dc.relation.ispartofTurk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi
dc.relation.publicationcategoryMakale - Uluslararası Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanı
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.snmzKA_20241106
dc.subjectDuyarliliği
dc.subjectEnterecoccus antibiotic resistance
dc.subjectEnterococcal infection
dc.subjectEnterococcus
dc.subjectEnterococcus faecalis
dc.subjectEnterococcus faecalis
dc.subjectEnterococcus faecium
dc.subjectEnterokok antibiyotik
dc.subjectEnterokok enfeksiyonu
dc.subjectFaecium
dc.titleEvaluation of antibiotic susceptibilities of enterococcus strains isolated from clinical samples of hospitalized patients
dc.title.alternativeHastanede yatan hastalarin klinik örneklerinden izole edilen enterokok suşlarinin antibiyotik duyarliliklarinin değerlendirilmesi
dc.typeArticle

Dosyalar

Koleksiyon

Scopus İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu