Investigation on prevalence of Roditis leaf discoloration-associated virus causing disease in grapevines in Turkey vineyards

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.advisorSerçe, Çiğdem Ulubaş
dc.contributor.authorAydınlık, Seda
dc.date.accessioned2024-11-04T20:06:13Z
dc.date.available2024-11-04T20:06:13Z
dc.date.issued2022
dc.departmentNiğde ÖHÜ, Fen Bilimleri Enstitüsü, Bitkisel Üretim ve Teknolojileri Ana Bilim Dalı
dc.descriptionFen Bilimleri Enstitüsü, Bitkisel Üretim ve Teknolojileri Ana Bilim Dalı
dc.description.abstractAsma Roditis yaprak renk değişikliği ile ilişkili virüs (GRLDaV), Türkiye'de asmalarda tespit edilen ilk DNA virüsüdür. Bu araştırma, Türkiye'de bağ alanlarında GRLDaV yaygınlığını araştırmak ve viral izolatların varyasyon durumunu DNA sekansı ve filogenetik analizlerle belirlemek amacıyla yapılmıştır. Test edilen 800 asma örneğinde GRLDaV enfeksiyon oranı %8,12 olarak belirlenmiştir. Bölgeleri temsil eden iller bazında test edilen örneklerde Bursa'da GRLDaV enfeksiyonu %1,04, Manisa'da %2,15, İzmir'de %67,56, Denizli'de %9,1, Adıyaman'da %4, Şanlıurfa'da %11,3, Elazığ'da %7,6, Antalya'da %57,14, Mersin'de %47,5, Adana'da %6,25, Kahramanmaraş'ta %4,76 ve Ankara'da %4,76 oranında tespit edilmiştir. Batman, Diyarbakır, Mardin, Gaziantep, Malatya, Tekirdağ, Çanakkale, Burdur, Isparta Konya ve Nevşehir'den alınan örneklerde GRLDaV tespit edilmemiştir. İlkbahar sonu ve sonbaharda toplanan örneklerde GRLDaV enfeksiyon oranı sırasıyla %9,26 ve %9,59 olarak belirlenmiştir. Filogenetik analiz sonuçlarına göre GRLDaV izolatları intraspesifik çeşitlilik göstermiş, grup 1 ve 2 olarak iki ana gruba ayrılmış ve grup 2 ayrıca kendi içinde 2a ve 2b olarak belirtilen alt gruplara ayrılmıştır. Bu çalışma, dünyada ve Türkiye'de kapsamlı GRLDaV surveyi yapılan ilk çalışmadır.
dc.description.abstractGrapevine Roditis leaf discoloration associated virus (GRLDaV) is the first DNA virus detected in grapevines in Turkey. This research scope was to investigate the prevalence of GRLDaV in vineyard areas in Turkey and to determine the variability of the viral isolates with DNA sequence and phylogenetic analysis. GRLDaV infection rate was determined as 8.12% among the 800 tested grapevine samples. Based on the provinces to represent the regions, GRLDaV infection in the samples tested was 1.04% from Bursa, 2.15% from Manisa, 67.56% from İzmir, 9.1% from Denizli, 4% from Adıyaman, 11.3% from Şanlıurfa, 7.6% from Elazığ, 20% from Antalya, 57.14% from Mersin, 47.5% from Adana, 6.25% from Kahramanmaraş and 4.76% from Ankara. GRLDaV was not detected among the samples obtained from Batman, Diyarbakır, Mardin, Gaziantep, Malatya, Tekirdağ, Çanakkale, Burdur, Isparta Konya and Nevşehir. The GRLDaV infection rate was 9.26% and 9.59% among the samples collected in late spring and autumn, respectively. According to phylogenetic analysis, GRLDaV isolates were divided in two main groups as indicated group 1 and 2 and, group 2 divided in subgroups as indicated 2a and 2b, highlighting the extensive intraspecific diversity. This study is the first comprehensive survey for GRLDaV in the world and in Turkey.
dc.identifier.endpage72
dc.identifier.startpage1
dc.identifier.urihttps://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=5XiSE4yCP_gmnukpMEp65aZ-G_JktrXmgPaaouvP1-gcTLvwIvgBlXGYBeLK0J28
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11480/8962
dc.identifier.yoktezid712249
dc.language.isoen
dc.publisherNiğde Ömer Halisdemir Üniversitesi
dc.relation.publicationcategoryTez
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.snmzKA_2024
dc.subjectZiraat
dc.subjectAgriculture
dc.titleInvestigation on prevalence of Roditis leaf discoloration-associated virus causing disease in grapevines in Turkey vineyards
dc.title.alternativeTürkiye bağlarında asmada hastalık yapan Roditis yaprak renk değişikliği ilişkili virüs (Roditis leaf discoloration associated virus)'ün yaygınlığı üzerine araştırmalar
dc.typeMaster Thesis

Dosyalar

Koleksiyon

Fen Bilimleri Enstitüsü Tez Koleksiyonu