Escherichia coli O157:H7'yi enfekte eden bakteriyofajların izolasyonu, karakterizasyonu ve ıspanak ve hıy0arda biyokoruyucu olarak kullanılma imkânlarının belirlenmesi

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.advisorYıldırım, Zeliha
dc.contributor.authorSakin Şahin, Tuba
dc.date.accessioned2021-12-29T13:42:33Z
dc.date.available2021-12-29T13:42:33Z
dc.date.issued2021
dc.date.submitted2021-06
dc.departmentNiğde ÖHÜ, Fen Bilimleri Enstitüsü, Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
dc.description.abstractBu çalışmada E. coli O157:H7'yi enfekte eden 22 tane faj izole edilip saflaştırılmıştır. Fajlardan konak hücre aralığı en geniş olan fajların Eco-OH6, OH5 ve OH8 olduğu ve EOP değerlerinin 0,01-1,0 arasında değiştiği saptanmıştır. Çalışmanın devamında 4 faj seçilip (Eco-OH5, OH6, OH8 ve OH12) ve plak boyutlarının 0,88-1,02 mm arasında olduğu belirlenmiştir. TEM analizi ile Eco-OH6, OH8 ve OH12'nin Myoviridae, Eco-OH5 fajının ise Siphoviridae familyasında olduğu belirlenmiştir. Fajların genomunda stx1 ve stx2 gen bölgelerine rastlanmamıştır. Tek aşamalı gelişim kurvesi ile 15-25 dk arasında latent dönemleri ve 49 ile 208 pob/hücre arasında patlama büyüklükleri olduğu belirlenmiştir. MOI değeri vB_EcoM-OH6 fajı için 1; vB_EcoS-OH5 ve vB_EcoM-OH12 için 0,0001; vB_EcoM-OH8 için ise 0,01 olarak bulunmuştur. Fajların geniş pH (2-12) ve sıcaklık (50°C -90°C) aralığında stabilitelerini korudukları ve inkübasyonun ilk 5 dakikasında konak hücrelerine %99'un üzerinde adsorbe oldukları belirlenmiştir. Fajların sıvı besiyerinde 37, 30 ve 20°C'de ve buzdolabı koşullarında kuvvetli litik aktivite gösterdikleri belirlenmiştir. Hıyar ve ıspanak örneklerinde hem 4°C hem 10°C'de muhafaza süresince E. coli O157:H7 sayısını düşürdükleri belirlenmiştir.
dc.description.abstractIn this study, 22 phages infecting E. coli O157:H7 were isolated and purified. It was determined that the phages with the largest host cell range were Eco-OH6, OH5 and OH8 and their EOP values varied between 0,01-1,0. In the continuation of the study, 4 phages were selected (Eco-OH5, OH6, OH8 and OH12) and plaque sizes were determined to be between 0,88-1,02 mm. By TEM analysis, it was determined that Eco-OH6, OH8 and OH12 were in the Myoviridae family and Eco-OH5 phage was in the Siphoviridae family. The stx1 and stx2 gene regions were not found in the genome of phages. The latent periods were determined between 15-25 min and burst sizes between 49 and 208 pob/cell with one-step growth experiment. MOI value was 1 for vB_EcoM-OH6 phage, 0,0001 for vB_EcoS-OH5 and vB_EcoM-OH12; 0,01 for vB_EcoM-OH8. It was determined that the phages remained stable in a wide range of pH (2-12) and temperature (50°C -90°C) and adsorbed over rate of 99% of the host cells in the first 5 minutes of incubation. It was determined that phages showed strong lytic activity in liquid medium at 37, 30 and 20°C and under refrigerated conditions. It was determined that they decreased the number of E. coli O157:H7 during storage at both 4°C and 10°C in cucumber and spinach samples.
dc.identifier.citationSakin, Şahin, T. (2021). Escherichia coli O157H7'yi enfekte eden bakteriyofajların izolasyonu, karakterizasyonu ve ıspanak ve hıy0arda biyokoruyucu olarak kullanılma imkânlarının belirlenmesi. (Doktora Tezi) Niğde Ömer Halisdemir Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Niğde
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11480/8638
dc.identifier.yoktezid675617
dc.language.isotr
dc.publisherNiğde Ömer Halisdemir Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü
dc.relation.publicationcategoryTez
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.subjectBakteriyofaj
dc.subjectBiyokoruyucu
dc.subjectEscherichia coli O157:H7
dc.subjectMorfolojik
dc.subjectLatent periyot
dc.subjectPatlama büyüklüğü
dc.subjectShiga toksin
dc.subjectStabilite
dc.subjectLitik aktivite
dc.subjectHıyar
dc.subjectIspanak
dc.subjectBacteriophage
dc.subjectBioprotective
dc.subjectEscherichia coli O157:H7
dc.subjectMorphology
dc.subjectLatent period
dc.subjectBurst size
dc.subjectShiga toxin
dc.subjectStability
dc.subjectLytic activity
dc.subjectCucumber
dc.subjectSpinach
dc.titleEscherichia coli O157:H7'yi enfekte eden bakteriyofajların izolasyonu, karakterizasyonu ve ıspanak ve hıy0arda biyokoruyucu olarak kullanılma imkânlarının belirlenmesi
dc.title.alternativeThe isolation, characterization of the bacteriophages infecting Escherichia coli O157: H7, and determination of their using possibilities as a bioprotective on spinach and cucumber
dc.typeDoctoral Thesis

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
Escherichia coli O157H7'yi enfekte eden bakteriyofajların izolasyonu, karakterizasyonu ve ıspanak ve hıy0arda biyokoruyucu olarak kullanılma imkânlarının belirlenmesi.pdf
Boyut:
32.12 MB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
İndir
Lisans paketi
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim Yok
İsim:
license.txt
Boyut:
1.44 KB
Biçim:
Item-specific license agreed upon to submission
Açıklama:
İndir

Koleksiyon

Fen Bilimleri Enstitüsü Tez Koleksiyonu