Yabani Soya Glycine Türlerinde Sentromerik Histon H3 Genlerinin Moleküler Klonlanması ve Biyoinformatik Analizi

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.authorTek, Ahmet L.
dc.date.accessioned2024-11-07T13:15:47Z
dc.date.available2024-11-07T13:15:47Z
dc.date.issued2019
dc.departmentNiğde Ömer Halisdemir Üniversitesi
dc.description01.10.2019
dc.description.abstractTüm ökaryotlarda yapısal ve islevsel olarak korunmus bulunan sentromer, kromozomun dogru bir sekilde dagılımında önemlidir. Ökaryot sentromerlerinde sentromere özgü histon H3 (CENH3) proteini islevsel özelligi saglamada önemli bir isaret olarak kabul edilmektedir. Birçok farklı organizma da ayrıntılı olarak tanımlanan CenH3 geninin türe özgünlügü, yüksek derecede degisken özellikleri ve farklı formları ön plana çıkmıstır. Türe özgü farklı formlarının bulunmasının sebebi amino asit dizilerinin N terminal ve C terminal bölgelerinde farklı oranlarda amino asit dizilerin konumlanmasından kaynaklıdır. Bu da organizmalar arasında özgünlügü olusturur. Bir takım arastırmalar sonucunda elde edilen veriler, bu farklılıgın altında yatan sebeplerin seleksiyon baskısından kaynaklandıgına isaret etmektedir. CenH3?nin sentromer üzerindeki önemi düsünüldügünde, kültüre alınmıs ve yabani Glycine soya türlerinin CenH3 geninin moleküler yapısının ayrıntılı olarak incelenmeye ihtiyacı vardır. Bu çalısmada soya ve yabani soya türlerinde total RNA izolasyonu, ters transkiptaz yardımıyla cDNA sentezi, gene özel primerlerle genin çogaltılması, DNA fragmentlerinin klonlanması ve dizilemesi yapılmıstır. CENH3 protein dizi bilgisinin biyoinformatik yöntemlerle karsılastırmalı analizi yapılarak türlerarası amino asit benzerlik ve farklılıkları tespit edilmistir. Analiz sonucu CENH3a ve CENH3b olarak adlandırılan 2 farklı temel form tespit edilmistir. Iki formun çoklu nükleotid ve protein hizalaması sonucu benzerlik oranı %95-%92.7 olarak tespit edilmistir. Biyoinformatik analizler sonucunda CENH3a formu CENH3b formuna kıyasla daha fazla pozitif seleksiyon göstermistir. Çalısmamız yabani soya türlerinde CenH3 geninin tespit edilmesine yönelik yapılan ilk kapsamlı çalısma olması nedeniyle diger ökaryotik türlerdeki sentromer çalısmalarına katkı saglayacagı düsünülmektedir. Tarımsal önemi olan bitkilerde yüksek oranda homozigot olan ebeveynlerin elde edilmesi önemli bir ıslah hedefidir. Bu hedefe ulasmada bitki türlerine özgü bazı haploid üretim yöntemleri mevcuttur. Son yıllarda sentromer modifikasyonu ile de haploid bitkilerin üretilebilecegine dair bazı modern yaklasımlar gelistirilmistir. Ileri teknolojiler kullanarak CenH3 geni üzerinden haploid soya ıslah hatlarının gelistirilmesi potansiyeli bulunmaktadır.
dc.identifier.endpage59
dc.identifier.startpage1
dc.identifier.trdizinid622136
dc.identifier.urihttps://search.trdizin.gov.tr/tr/yayin/detay/622136
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11480/11861
dc.indekslendigikaynakTR-Dizin
dc.language.isotr
dc.relation.publicationcategoryProje
dc.relation.tubitakinfo:eu-repo/grantAgreement/TUBITAK/TOVAG/1180670
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.snmzKA_20241107
dc.subjectBiyoloji
dc.subjectGenetik ve Kalıtım
dc.subjectBitki Bilimleri
dc.subjectZooloji
dc.subjectHaploid
dc.subjectıslah
dc.subjectcenh3
dc.subjectsoya
dc.subjectsentromerik histon h3
dc.titleYabani Soya Glycine Türlerinde Sentromerik Histon H3 Genlerinin Moleküler Klonlanması ve Biyoinformatik Analizi
dc.typeProject

Dosyalar

Koleksiyon

TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu