Patateste Kuraklık ve Yüksek Sıcaklığa Toleransı Düzenleyen miRNA'ların ve İşlevlerinin Belirlenmesi
Küçük Resim Yok
Tarih
2019
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
Bu projede toleranslı ve hassas çesitlerden elde edilen sonuçların karsılastırılması ile patateste kuraklıga, yüksek sıcaklıga, ve kuraklık + yüksek sıcaklıga tepkide ve/veya toleransta rol oynayan miRNA'lar ile onların hedef genlerinin bulunması ve transgenik yaklasım ile islevlerinin arastırılması hedeflenmistir. Yeni nesil dizileme ile miRNA transkriptomlarının karsılastırılması için kuraklıga toleransı yüksek patates çesidi olarak Unica, hassas patates çesidi olarak da Russet Burbank kullanılmıstır. Bu amaçla Unica ve Russet Burbank patates çesitleri kuraga, yüksek sıcaklıga ve kurak + yüksek sıcaga maruz bırakılmıs ve yeni nesil dizileme ile 104'ü yeni (daha önce bulunmamıs) ve 210'u bilinen olmak üzere 314 miRNA tanımlanmıstır. Biyoinformatik analizler ile bu miRNA'ların hedef genleri tespit edildikten sonra, patates çesidine ve/veya uygulanan strese göre degerlendirilmeleri yapılarak 24 potansiyel miRNA seçilmis ve bunlardan 14 miRNA ve hedef geninin uygulamaya baglı anlatım degisimi qRT-PCR ile dogrulanmıstır. qRT-PCR sonuçları ve hedef genlerin rolleri de degerlendirilerek novel_8 (hedef gen; mitokondriyel transkripsiyon sonlandırıcı faktör ailesi proteini), novel_9 (hedef gen; NBS-LRR resistans protein), novel_105 (hedef gen; çinko parmak transkripsiyon faktör protein), stu-miR156d-3p (hedef gen; fosfolipid tasıyıcı ATPaz), stu-miR160a-5p (hedef gen; oksin cevap faktörü ARF16), stumiR162a- 3p (hedef gen; endoribonukleaz Dicer homolog proteini 1), stu-miR172b-3p (hedef gen; AP2 transkripsiyon faktörü) ve stu-miR398a-5p (hedef gen; kloroplastik fotosistem II çekirdek kompleks protein psbY) transgenik yaklasımda kullanılmak üzere seçilmistir. Bunlardan novel_9, miR162a-3p ve miR398a-5p için transgenik patates bitkisi elde edilemezken, diger bes miRNA için hem Unica, hem de Russet Burbank'de transgenik patates hatları ve mini yumrular elde edilmistir. Yumrulardan büyütülen transgenik hatlar yeniden kuraklık, yüksek sıcaklık ve kuraklık + yüksek sıcaklık streslerine maruz bırakılmıs ve miRNA transformasyonu sonrası strese tolerans seviyelerindeki degisiklikler incelenmistir. Proje çalısmaları sonucunda gerek kuraklık, gerekse yüksek sıcaklık kosullarında büyütüldügünde verim kaybı oranı azalmıs olan umut vadeded transgenik hatlara ulasılmıs durumdadır. Ilerleren çalısmalarla bu hatların degisen iklim kosullarında patates tarımının devamlılıgını saglamada önemli etkisi olacagı düsünülmektedir.
Açıklama
01.10.2019
Anahtar Kelimeler
Biyoloji, Çevre Bilimleri, Paleontoloji, Oşinografi, Sıcaklık stresi, patates, kuraklık stresi, transgenik, mirna
