Patateste Kuraklık ve Yüksek Sıcaklığa Toleransı Düzenleyen miRNA'ların ve İşlevlerinin Belirlenmesi

dc.contributor.authorGökçe, Zahıde Neslıhan Öztürk
dc.contributor.authorAksoy, Emre
dc.contributor.authorÇalışkan, Sevgi
dc.contributor.authorÇalışkan, Mehmet Emin
dc.contributor.authorDemirel, Ufuk
dc.contributor.authorBakhsh, Allah
dc.date.accessioned2024-11-07T13:15:48Z
dc.date.available2024-11-07T13:15:48Z
dc.date.issued2019
dc.departmentNiğde Ömer Halisdemir Üniversitesi
dc.description01.10.2019
dc.description.abstractBu projede toleranslı ve hassas çesitlerden elde edilen sonuçların karsılastırılması ile patateste kuraklıga, yüksek sıcaklıga, ve kuraklık + yüksek sıcaklıga tepkide ve/veya toleransta rol oynayan miRNA'lar ile onların hedef genlerinin bulunması ve transgenik yaklasım ile islevlerinin arastırılması hedeflenmistir. Yeni nesil dizileme ile miRNA transkriptomlarının karsılastırılması için kuraklıga toleransı yüksek patates çesidi olarak Unica, hassas patates çesidi olarak da Russet Burbank kullanılmıstır. Bu amaçla Unica ve Russet Burbank patates çesitleri kuraga, yüksek sıcaklıga ve kurak + yüksek sıcaga maruz bırakılmıs ve yeni nesil dizileme ile 104'ü yeni (daha önce bulunmamıs) ve 210'u bilinen olmak üzere 314 miRNA tanımlanmıstır. Biyoinformatik analizler ile bu miRNA'ların hedef genleri tespit edildikten sonra, patates çesidine ve/veya uygulanan strese göre degerlendirilmeleri yapılarak 24 potansiyel miRNA seçilmis ve bunlardan 14 miRNA ve hedef geninin uygulamaya baglı anlatım degisimi qRT-PCR ile dogrulanmıstır. qRT-PCR sonuçları ve hedef genlerin rolleri de degerlendirilerek novel_8 (hedef gen; mitokondriyel transkripsiyon sonlandırıcı faktör ailesi proteini), novel_9 (hedef gen; NBS-LRR resistans protein), novel_105 (hedef gen; çinko parmak transkripsiyon faktör protein), stu-miR156d-3p (hedef gen; fosfolipid tasıyıcı ATPaz), stu-miR160a-5p (hedef gen; oksin cevap faktörü ARF16), stumiR162a- 3p (hedef gen; endoribonukleaz Dicer homolog proteini 1), stu-miR172b-3p (hedef gen; AP2 transkripsiyon faktörü) ve stu-miR398a-5p (hedef gen; kloroplastik fotosistem II çekirdek kompleks protein psbY) transgenik yaklasımda kullanılmak üzere seçilmistir. Bunlardan novel_9, miR162a-3p ve miR398a-5p için transgenik patates bitkisi elde edilemezken, diger bes miRNA için hem Unica, hem de Russet Burbank'de transgenik patates hatları ve mini yumrular elde edilmistir. Yumrulardan büyütülen transgenik hatlar yeniden kuraklık, yüksek sıcaklık ve kuraklık + yüksek sıcaklık streslerine maruz bırakılmıs ve miRNA transformasyonu sonrası strese tolerans seviyelerindeki degisiklikler incelenmistir. Proje çalısmaları sonucunda gerek kuraklık, gerekse yüksek sıcaklık kosullarında büyütüldügünde verim kaybı oranı azalmıs olan umut vadeded transgenik hatlara ulasılmıs durumdadır. Ilerleren çalısmalarla bu hatların degisen iklim kosullarında patates tarımının devamlılıgını saglamada önemli etkisi olacagı düsünülmektedir.
dc.identifier.endpage309
dc.identifier.startpage1
dc.identifier.trdizinid622012
dc.identifier.urihttps://search.trdizin.gov.tr/tr/yayin/detay/622012
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11480/11865
dc.indekslendigikaynakTR-Dizin
dc.language.isotr
dc.relation.publicationcategoryProje
dc.relation.tubitakinfo:eu-repo/grantAgreement/TUBITAK/TOVAG/115O405
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.snmzKA_20241107
dc.subjectBiyoloji
dc.subjectÇevre Bilimleri
dc.subjectPaleontoloji
dc.subjectOşinografi
dc.subjectSıcaklık stresi
dc.subjectpatates
dc.subjectkuraklık stresi
dc.subjecttransgenik
dc.subjectmirna
dc.titlePatateste Kuraklık ve Yüksek Sıcaklığa Toleransı Düzenleyen miRNA'ların ve İşlevlerinin Belirlenmesi
dc.typeProject

Dosyalar