Nannospalax Nehringi ve Nannospalax ehrenbergi (Rodentia, spalacidae) türlerinde PCR-RFLP ile mitokondriyal DNA D-loop ve sitokrom B bölgelerinin haplotip çeşitliliği

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.advisorKankılıç, Teoman
dc.contributor.authorGürpınar, Canan
dc.date.accessioned2019-12-04T10:56:05Z
dc.date.available2019-12-04T10:56:05Z
dc.date.issued2012
dc.date.submitted2012-06
dc.departmentNiğde ÖHÜ, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoloji Ana Bilim Dalı
dc.description.abstractRFLP metodu kullanılarak mt-DNA D-loop ve sitokrom b bölgelerindeki genetik farklılıklar Nannospalax xanthodon ve Nannospalax ehrenbergi türleri arasında belirlendi. Anadolu'da yaşayan iki tür için Nannospalax xanthodon (62 populasyon) ve Nannospalax ehrenbergi (2 populasyon) toplam 94 örnek çalışıldı.Mitokondriyal DNA'da genetik farklılıkları belirlemek için, mt-DNA'nın iki bölgesi (790 bp uzunluğunda D-loop ve 500 bp uzunluğunda Cyt-b) izole edildi ve BamH-I, Taq-I, Alu-I and Msp-I restriksiyon endonükleaz enzimleri ile kesildi. BamH-I D-loop bölgesini kesmezken, Alu-I, Msp-I and Taq-I enzimleri bu bölgeyi pek çok örnekte sırasıyla 100-240-450 bp, 280-510bp, 170-620bp uzunluğunda bölgelerden kesti. Sitokrom b bölgesinde ise Bamh-I, Msp-I and Taq-I enzimleri bu bölgeyi pek çok örnekte sırasıyla 110-130-260bp, 200-300bp, 200-230-270-300bp uzunluğunda bölgelerden kesti. Filogenetik yapı Batı Anadolu'nun kromozomal formlarının Anadolu'daki diğer kromozomal formlardan farklı olduğunu gösterdi. Batı Anadolu formları ve diğer bölgelerdeki kromozomal formlar arasında genetik mesafe yüksek bulundu.
dc.description.abstractGenetic difference between the mt DNA D-loop and Cyt-b region was determined in the two species Nannospalax xanthodon and Nannospalax ehrenbergi using Pcr-RFLP method. 94 mole rat samples belonging to two species S. xanthodon (62 populations) and S. ehrenbergi (2 populations) distributed in Anatolia were studiedIn order to detect genetic differences in mtDNA, DNA was isolated two parts of 790 bp of D-loop and 500 bp of Cyt-b in mt DNA was amplified and cut with BamH-I, Taq-I, Alu-I and Msp-I restriction enzymes. BamH-I enzyme didn?t cut the D-loop region while Alu-I, Msp-I and Taq-I enzymes cut a lot of samples in 100-240-450 bp, 280-510bp, 170-620bp-length bands, respectively. In the amplified region for cyt-b region: Bamh-I, Msp-I and Taq-I enzymes cut a lot of samples in 110-130-260bp, 200-300bp, 200-230-270-300bp lenght bands, respectively.In our phylogenetic reconsruction show that the chromosome forms of Western Anatolia is different from all other chromosome forms of Anatolia. Genetic distance is found high between western forms and other chromosome forms.
dc.identifier.citationGürpınar, C. (2012). Nannospalax Nehringi ve Nannospalax ehrenbergi (Rodentia, spalacidae) türlerinde PCR-RFLP ile mitokondriyal DNA D-loop ve sitokrom B bölgelerinin haplotip çeşitliliği. (Yüksek Lisans Tezi). Niğde Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Niğde
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11480/7434
dc.identifier.yoktezid329329
dc.institutionauthorGürpınar, Canan
dc.language.isotr
dc.publisherNiğde Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü
dc.relation.publicationcategoryTez
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.subjectNannospalax Xanthodon
dc.subjectNannospalax Ehrenbergi
dc.subjectSitotip
dc.subjectRFLP
dc.subjectCytotype
dc.titleNannospalax Nehringi ve Nannospalax ehrenbergi (Rodentia, spalacidae) türlerinde PCR-RFLP ile mitokondriyal DNA D-loop ve sitokrom B bölgelerinin haplotip çeşitliliği
dc.title.alternativeHaplotip diversity of the mitochondrial DNA D-loop and cytochrome B regions in Nannospalax nehringi and Nannospalax ehrenbergi (Rodentia, Spalacidae) detected by PCR-RFLP
dc.typeMaster Thesis

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
Nannospalax Nehringi ve Nannospalax ehrenbergi (Rodentia, spalacidae) türlerinde PCR-RFLP ile mitokondriyal DNA D-loop ve sitokrom B bölgelerinin haplotip çeşitliliği.pdf
Boyut:
6.99 MB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin / Full Text
İndir
Lisans paketi
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim Yok
İsim:
license.txt
Boyut:
1.44 KB
Biçim:
Item-specific license agreed upon to submission
Açıklama:
İndir

Koleksiyon

Fen Bilimleri Enstitüsü Tez Koleksiyonu