Kırgızistan'ın Chui bölgesindeki Cucumber mosaic virüs'ün serolojik ve moleküler teşhisi ile karakterizasyonu

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.advisorSerçe, Çiğdem Ulubaş
dc.contributor.authorMazenov, Atayar
dc.date.accessioned2019-10-25T08:32:51Z
dc.date.available2019-10-25T08:32:51Z
dc.date.issued2018
dc.date.submitted2018-08
dc.departmentNiğde ÖHÜ, Fen Bilimleri Enstitüsü, Bitkisel Üretim ve Teknolojileri Ana Bilim Dalı
dc.description.abstractKırgızistan’ın Chui bolgesindeki Cucurbitaceae ve Solanaceae kültür bitkilerinde zararlı Hıyar Mozayik Virüsü (Cucumber mosaic virus, CMV)’nün serolojik ve moleküler teşhisi yapılmıştır. Chui bölgesinin farklı ilçelerindeki tarlalardan toplanan hıyar, kabak, domates, biber, kavun ve patates bitkilerinden oluşan toplam 96 simptomlu bitki örneği, DAS-ELISA, dot-blot, Immunocapture (IC) RT-PCR, IC-real time PCR yöntemleri ile test edilmiştir. DAS-ELISA testine göre CMV infeksiyon oranı % 3,12 olarak saptanmıştır. IC-RT-PCR yöntemi ile analizler sonucu infeksiyon oranı % 6,25, IC-real time-PCR analizine göre infeksiyon oranı %100 olarak tespit edilmiştir. IC-RT-PCR yöntemi ile tespit edilen CMV enfekteli örnekler CMV ırk tayini için tip spesifik ELISA, tip spesifik PCR, RFLP ve kılıf protein dizileme yöntemleri ile analiz edilmiştir. Tespit edilen tüm CMV izolatlarının CMV altgrup IB olduğu belirlenmiştir. CMV’nin Solanacae ve Cucurbitace bitkilerde enfeksiyonu ve CMV-IB ırkı Kırgızistan için ilk kayıttır.
dc.description.abstractSerological and molecular diagnosis of the cucumber mosaic virus (CMV) was carried out in Cucurbitaceae and Solanaceae cultural plants in the Chui region of Kyrgyzstan. A total of 96 symptomatic plant samples including cucumber, squash, tomato, pepper, melon and potato collected from different areas of the Chui area were tested by DAS-ELISA, dot-blot, Immunocapture (IC) RT-PCR and IC-real-time PCR methods. According to the DAS-ELISA test, the CMV infection rate was 3.12%. IC-RT-PCR analysis showed that the final infection rate was 6.25% and the infection rate was 100% according to IC-real-time-PCR analysis. CMV infected samples detected by IC-RT-PCR were analyzed by type-specific ELISA, type-specific PCR, RFLP and coat protein sequencing methods for CMV strain identification. It was determined that all CMV isolates identified were CMV subgroup IB. Infection of CMV with Solanaceae and Cucurbitaceae plants and CMV-IB is the first record for Kyrgyzstan.
dc.identifier.citationMazenov, A. (2018). Kırgızistan'ın Chui bölgesindeki Cucumber mosaic virüs'ün serolojik ve moleküler teşhisi ile karakterizasyonu. (Yüksek Lisans Tezi) Niğde Ömer Halisdemir Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Niğde : , , , , , ,
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11480/6819
dc.identifier.yoktezid526099
dc.institutionauthorMazenov, Atayar
dc.language.isotr
dc.publisherNiğde Ömer Halisdemir Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü
dc.relation.publicationcategoryTez
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.subjectCMV
dc.subjectELISA
dc.subjectPCR
dc.subjectIC-RT-PCR
dc.subjectReal-Time PCR
dc.subjectMultipleks PCR
dc.subjectRFLP
dc.titleKırgızistan'ın Chui bölgesindeki Cucumber mosaic virüs'ün serolojik ve moleküler teşhisi ile karakterizasyonu
dc.title.alternativeCharacterization of Cucumber mosaic virus in the Chui region of Kyrgyzstan by serological and molecular diagnosis
dc.typeMaster Thesis

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
Kırgızistan'ın Chui bölgesindeki Cucumber mosaic virüs'ün serolojik ve moleküler teşhisi ile karakterizasyonu.pdf
Boyut:
3.6 MB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin / Full Text
İndir
Lisans paketi
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim Yok
İsim:
license.txt
Boyut:
1.44 KB
Biçim:
Item-specific license agreed upon to submission
Açıklama:
İndir

Koleksiyon

Fen Bilimleri Enstitüsü Tez Koleksiyonu