Patateste kuraklık ve yüksek sıcaklık streslerine tepkide rol oynayan mirna'ların yeni nesil dizileme yöntemi ile belirlenmesi
Yükleniyor...
Tarih
2017
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Niğde Ömer Halisdemir Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
Patates kuraklık ve yüksek sıcaklık gibi abiyotik streslere hassas bir bitkidir. Bitkiler abiyotik stres cevabında miRNA'ları kullanarak stres ile ilgili genlerin transkipsiyon sonrası düzenlemesini sağlayarak strese karşı tolerans gösterdikleri bilinmektedir. Bu nedenle tez kapsamında, kuraklık, yüksek sıcaklık ve yüksek sıcaklık+kuraklık stresleri Unica ve Russset Burbank patates çe?itlerine uygulanarak stres durumunda ve çeşitler arasında meydana gelen miRNA transkriptomları incelenmiştir. Tez çalışması sonucunda, 210 tane bilinen ve 104 tane ise yeni bulunan toplam 314 tane miRNA elde edilmi?tir ve 24 adet miRNA'dan ve onların hedef genlerinden, qRT-PCR yapılmıştır. Bunun yanında stu-miR162-3p sadece kuraklık streslerinde artmı? ve hedef geni Endonükleaz homolog1 geninin ekspresyonu düşüş yaşamıştır yine aynı şekilde novel_9 sadece Russet Burbank çeşidinde artmış ve hedef geni NBS-LRR direnç geninin ekspresyonu düşüş yaşamıştır. Bundan dolayı novel_9 ve miR162-3p'nin patateste abiyotik stres cevabının anlaşılmasında önemli olacağı ve dayanıklı patates geliştirmesine yardımcı olacağı düşünülmektedir.
Potato is sensitive to abiotic stresses such as drought and high temperature. The plants are known to express tolerance to stress by using miRNAs in response to abiotic stress and stress-associated genes to regulate post-translation. For this reason, miRNA transcriptomics in the case of stress and among the varieties have been investigated by applying drought, high temperature and high temperature + drought stresses to Unica and Russset Burbank potato varieties. As a result of the thesis study, a total of 314 miRNA of 210 known and 104 novel were obtained. qRT-PCR was performed on 24 selected miRNAs and their target genes. In addition, stu-miR162-3p increased only in drought stresses, and the expression of the target gene Endonuclease homolog1 gene did not decrease, whereas the novel_9 increased only in the Russet Burbank variants and decreased the expression of the target gene NBS-LRR resistance gene.
Potato is sensitive to abiotic stresses such as drought and high temperature. The plants are known to express tolerance to stress by using miRNAs in response to abiotic stress and stress-associated genes to regulate post-translation. For this reason, miRNA transcriptomics in the case of stress and among the varieties have been investigated by applying drought, high temperature and high temperature + drought stresses to Unica and Russset Burbank potato varieties. As a result of the thesis study, a total of 314 miRNA of 210 known and 104 novel were obtained. qRT-PCR was performed on 24 selected miRNAs and their target genes. In addition, stu-miR162-3p increased only in drought stresses, and the expression of the target gene Endonuclease homolog1 gene did not decrease, whereas the novel_9 increased only in the Russet Burbank variants and decreased the expression of the target gene NBS-LRR resistance gene.
Açıklama
Anahtar Kelimeler
Solanum Tuberosum, Kuraklık, Yüksek Sıcaklık, Abiyotik Stres, MiRNA, Solanum Tuberosum, Drought and High Temparature, Abiotic Stress, MiRNA
Kaynak
WoS Q Değeri
Scopus Q Değeri
Cilt
Sayı
Künye
Kaplan, E. (2017). Patateste kuraklık ve yüksek sıcaklık streslerine tepkide rol oynayan mirna'ların yeni nesil dizileme yöntemi ile belirlenmesi. (Yüksek Lisans Tezi) Niğde Ömer Halisdemir Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Niğde
