Patateste kuraklık ve yüksek sıcaklık streslerine tepkide rol oynayan mirna'ların yeni nesil dizileme yöntemi ile belirlenmesi

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.advisorÖztürk Gökçe, Zahide Neslihan
dc.contributor.authorKaplan, Esra
dc.date.accessioned2019-10-11T13:12:05Z
dc.date.available2019-10-11T13:12:05Z
dc.date.issued2017
dc.date.submitted2017-07
dc.departmentNiğde ÖHÜ, Fen Bilimleri Enstitüsü, Tarımsal Genetik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
dc.description.abstractPatates kuraklık ve yüksek sıcaklık gibi abiyotik streslere hassas bir bitkidir. Bitkiler abiyotik stres cevabında miRNA'ları kullanarak stres ile ilgili genlerin transkipsiyon sonrası düzenlemesini sağlayarak strese karşı tolerans gösterdikleri bilinmektedir. Bu nedenle tez kapsamında, kuraklık, yüksek sıcaklık ve yüksek sıcaklık+kuraklık stresleri Unica ve Russset Burbank patates çe?itlerine uygulanarak stres durumunda ve çeşitler arasında meydana gelen miRNA transkriptomları incelenmiştir. Tez çalışması sonucunda, 210 tane bilinen ve 104 tane ise yeni bulunan toplam 314 tane miRNA elde edilmi?tir ve 24 adet miRNA'dan ve onların hedef genlerinden, qRT-PCR yapılmıştır. Bunun yanında stu-miR162-3p sadece kuraklık streslerinde artmı? ve hedef geni Endonükleaz homolog1 geninin ekspresyonu düşüş yaşamıştır yine aynı şekilde novel_9 sadece Russet Burbank çeşidinde artmış ve hedef geni NBS-LRR direnç geninin ekspresyonu düşüş yaşamıştır. Bundan dolayı novel_9 ve miR162-3p'nin patateste abiyotik stres cevabının anlaşılmasında önemli olacağı ve dayanıklı patates geliştirmesine yardımcı olacağı düşünülmektedir.
dc.description.abstractPotato is sensitive to abiotic stresses such as drought and high temperature. The plants are known to express tolerance to stress by using miRNAs in response to abiotic stress and stress-associated genes to regulate post-translation. For this reason, miRNA transcriptomics in the case of stress and among the varieties have been investigated by applying drought, high temperature and high temperature + drought stresses to Unica and Russset Burbank potato varieties. As a result of the thesis study, a total of 314 miRNA of 210 known and 104 novel were obtained. qRT-PCR was performed on 24 selected miRNAs and their target genes. In addition, stu-miR162-3p increased only in drought stresses, and the expression of the target gene Endonuclease homolog1 gene did not decrease, whereas the novel_9 increased only in the Russet Burbank variants and decreased the expression of the target gene NBS-LRR resistance gene.
dc.identifier.citationKaplan, E. (2017). Patateste kuraklık ve yüksek sıcaklık streslerine tepkide rol oynayan mirna'ların yeni nesil dizileme yöntemi ile belirlenmesi. (Yüksek Lisans Tezi) Niğde Ömer Halisdemir Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Niğde
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11480/6668
dc.identifier.yoktezid474236
dc.institutionauthorKaplan, Esra
dc.language.isotr
dc.publisherNiğde Ömer Halisdemir Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü
dc.relation.publicationcategoryTez
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.subjectSolanum Tuberosum
dc.subjectKuraklık
dc.subjectYüksek Sıcaklık
dc.subjectAbiyotik Stres
dc.subjectMiRNA
dc.subjectSolanum Tuberosum
dc.subjectDrought and High Temparature
dc.subjectAbiotic Stress
dc.subjectMiRNA
dc.titlePatateste kuraklık ve yüksek sıcaklık streslerine tepkide rol oynayan mirna'ların yeni nesil dizileme yöntemi ile belirlenmesi
dc.title.alternativeIdentification of mirnas in response to drought and heat stresses in potato using new generation sequencing
dc.typeMaster Thesis

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
Patateste kuraklık ve yüksek sıcaklık streslerine tepkide rol oynayan mirna'ların yeni nesil dizileme yöntemi ile belirlenmesi.pdf
Boyut:
5.64 MB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin / Full Text
İndir
Lisans paketi
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim Yok
İsim:
license.txt
Boyut:
1.44 KB
Biçim:
Item-specific license agreed upon to submission
Açıklama:
İndir

Koleksiyon

Fen Bilimleri Enstitüsü Tez Koleksiyonu